In einem einzigartigen historischen Ambiente werden in der Paulinerkirche im ersten Obergeschoss des Historischen Gebäudes auf einer Fläche von 680 Quadratmetern wechselnde Ausstellungen gezeigt, die der Göttinger Universitäts- und Wissenschaftsgeschichte, den Sammlungen der SUB Göttingen und bibliophilen Themen gewidmet sind. Als Ausstellungsarchitektur stehen fast 50 festeingebaute Vitrinen (darunter das sog. „Schatzhaus“) für die Präsentation von historischen Originaldokumenten und -objekten, weitere mobile Vitrinen und Stellwände zur Verfügung. Zudem bietet die Paulinerkirche einen besonderen Rahmen für wissenschaftliche und kulturelle Veranstaltungen.